Pada awal abad ke-21 pecah perang dunia. Bumi mengalami kerusakan besar, dan manusia mengungsi ke luar angkasa.
Manusia memulai sejarah baru yang ditandai dengan dimulainya kalender bintang tahun 00 dan dilarangnya semua kegiatan “mengganggu perasaan” seperti seni dan musik.
Pada tahun 0048 kalender bintang dibentuk grup idola AKB0048 sebagai penerus grup legendaris AKB48.
Namun penguasa memandang keberadaan AKB0048 sebagai pelanggaran hukum, Akibatnya, mereka tidak dapat melakukan konser resmi.
AKB0048 pun mengubah strategi “idola yang dapat kamu jumpai” menjadi “idola yang pergi menjumpai penggemar”.
Pengaruh AKB0048 begitu besar sehingga mereka diberi label sebagai grup teroris. Penguasa berusaha menekan mereka melalui berbagai cara.
Namun AKB0048 memiliki senjata dan pertahanan diri. Mereka terus berjuang membela rakyat, penggemar, dan panggung konser mereka.